这要看对方要什么发票了，

如果对方是个人或者小规模纳税人，你给他开的普通发票1000元就是含税发票，你收到1000元的现金，的入账收入就是1000/（1+4%）=961.53，交到税务局税金就是38.47。如果开具1040元发票增值税的应纳税额=1040/（1+4%）*4%=40元 ，收入是1000元。

如果对方是一般纳税人，你区国税局开具的是增值税专用发票，货物金额是1000元的话，还单有一个税金是40元，发票的金额合计是1040，你收到1000元，交40给税务！