按财务制度规定，赔偿费用进“营业外科目”，但根据税法规定，在申报企业所得税时，应在申报表中将赔偿费用调增应纳税所得额，不允许税前扣除。

赔偿不需要发票。因为不是买卖关系，开收据就可以了。

因为是导致部分货物破损，所以完整的分录：

借：材料采购或在途物资

应交税费——应交增值税（进项税额）

贷：银行存款等

入库时：

借：库存商品等

其他应收款——物流公司

贷：材料采购或在途物资

将来收到款项时：

借：银行存款

贷：其他应收款

同时注意部分货物破损的情况。