货物已确认收入，说明货物已经出库并结转了成本，销售业务已经成立了。

你的亏损如果是指货物本身的品质问题的话，我认为有以下两种处理方法。

可以使用，给客户部分折让，会计处理如下

借：主营业务收入 （退给客户的金额）

应交税费－应交增值税（销项税额） （根据退的金额算税额）

贷：应收账款或银行存款

不能使用，全额退回。会计处理如下：

借：主营业务收入

应交税费－应交增值税（销项税额）

贷：应收账款或银行存款

借：库存商品

贷：主营业务成本

需要注意的是：如果开出的发票是当月的，没有跨月，可在收回后作废。如果跨月了，要到税务局办理开具红字发票。