燃油附加费计入交通运输费用”科目。

详细解释如下：

当企业在运营过程中，会产生各种费用，这些费用需要根据其性质和用途进行恰当的科目归类。燃油附加费作为企业运营中因使用燃油而产生的额外费用，应当记入交通运输费用”科目。

交通运输费用”科目主要核算企业在运输过程中的各种费用，包括燃油费、通行费、运输工具的维护修理费等。燃油附加费作为燃油费用的一个组成部分，直接与企业运输业务的运营成本相关，因此应当纳入这一科目进行核算。

在进行会计处理时，企业需设置具体的明细科目来准确反映燃油附加费的金额。这样做不仅有助于企业内部的成本控制和预算管理，也有助于外部审计和财务报告的编制，确保财务信息的准确性和透明度。

总之，燃油附加费应记入交通运输费用”科目下的相关明细科目，以正确反映企业的运营成本并进行有效的财务管理。