会计上，实行“免、抵、退”政策的账务处理也相应有三种处理办法。

一是，应纳税额为正数，即免抵后仍应缴纳增值税，免抵税额=免抵退税额，即没有可退税额(因为没有留抵税额)。此时，账务处理如下：

借：应交税金——应交增值税(转出未交增值税)

贷：应交税金——未交增值税

借：应交税金——应交增值税(出口抵减内销产品应纳税额)

贷：应交税金——应交增值税(出口退税)

二是，应纳税额为负数，即期末有留抵税额，对于未抵顶完的进项税额，不做会计分录;当留抵税额大于“免、抵、退”税额时，可全部退税，免抵税额为0.此时，账务处理如下：

借：应收补贴款

贷：应交税金——应交增值税(出口退税)

三是，应纳税额为负数，即期末有留抵税额，对于未抵顶完的进项税额，不做会计分录;当留抵税额小于“免、抵、退”税额时，可退税额为留抵税额，免抵税额=免抵退税额-留抵税额。此时，账务处理如下：

借：应收补贴款

应交税金——应交增值税(出口抵减内销产品应纳税额)

贷：应交税金——应交增值税(出口退税)

通过以上三种情况的分析与处理可看出，如果不计算出“免抵税额”，会计处理上将无法平衡。