按会计准则是要分不同情况来处理的：

1，如果是采购环节合理损失要视情况而定。

A，采购运输环节合理损耗，成本还是那么多钱，但是单位成本要上升。

B，如果有责任人，应入其他应收款。

C，属于非正常损失（自然灾害等）计入营业外支出

D，原因不明时可以通过处理财产损溢科目核算，查明原因后再作相应处理。

2，如果是入库环节亏损

A，入库前的挑选整理费用，应计入存货的入账价值。

B，入库以后发生的挑选整理费用、保管费用应计入管理费用中。

3，如果是期末存货出现盘点亏损也要视情况而定。

A，一般有责任人的，当然要赔偿。

B，没有责任人，属于管理不善的计入管理费用

C，属于非正常损失的（自然灾害等）计入营业外支出

D，如果是生产过程合理损耗，计入生产成本

4，如果是期末存货有减值，也需要处理。