项目补助计入“专项应付款”科目。

详细解释如下：

1. 项目补助的性质：项目补助通常是由政府或其他机构针对特定项目提供的财务支持。这些补助资金的目的是为了帮助项目顺利进行，降低项目的财务风险。

2. 专项应付款科目的应用：在会计上，“专项应付款”科目用于记录企业因特定项目而收到的需要单独核算的补助资金。这些资金通常有其特定的用途和限制条件，需要专项管理。

3. 项目补助的会计处理：当企业收到项目补助时，应将其记入“专项应付款”科目，并在相关的项目成本中进行分配。如果补助资金用于购买固定资产或支付其他相关费用，应根据具体情况进行资本化或费用化处理。

4. 确保合规性：对于项目补助的使用和管理，企业应当严格按照相关规定和条件进行，确保资金的合规性和透明性，同时做好相关的记录和报告工作。

总的来说，项目补助在会计上应计入“专项应付款”科目，企业需严格按照相关规定进行会计处理，确保资金的合规使用和管理。