经营损失的计算规则是：

1、造成的公司直接经济损失5000元及以下部分，直接责任人按100％进行赔偿；

2、超过5000－10000（含10000）元部分，直接责任人按80％进行赔偿，上一、二级主管各按10％进行赔偿；

3、超过10000元部分，直接责任人按50％进行赔偿，上面各级主管各按5％进行赔偿。

法院判定经营损失的依据一般以其交税核定的经营额，较合适、根据上税的情况判定较合理，比如平时问，效益如何。