其应计入管理费用科目。

根据查询华图教育显示，无法查明原因的现金短缺应计入管理费用，应由责任方赔偿的现金短缺计入其他应收款。属于应支付给有关人员或单位的现金溢余计入其他应付款，属于无法查明原因的现金溢余计入营业外收入。

现金短缺的基本账务处理：借：待处理财产损溢，贷：库存现金；得到批准后：借：其他应收款（应由责任方赔偿的部分），管理费用（无法查明原因的，补缺时），贷：待处理财产损溢。