银行存款是通过账目核对和审计来进行清查的。

银行存款的清查十分重要，这是确保企业财务状况准确性的关键环节。企业对于银行存款的清查，主要采取以下方式：

1. 账目核对。这是最基本的清查方式。通过对比银行提供的对账单和企业自身的账目记录，核查每一笔存款的进出情况，确保双方账目相符。这种方法直观、简便，能够及时发现并纠正错误。

2. 审计清查。对于大型企业或金融机构，通常会聘请专业的审计机构进行银行存款的清查。审计机构会进行详细的财务审计，包括对企业银行存款管理制度的审查、对银行存款账户的检查以及对银行存款相关人员的访谈等，以确保存款的安全性和真实性。

此外，还有一些辅助手段用于支持银行存款的清查，如利用银行提供的电子对账系统，这可以提高对账效率，减少人为错误。

总之，银行存款的清查主要依靠账目核对和审计手段来完成。通过这些方式，企业可以确保其银行存款的真实、准确和安全，为企业的稳健运营提供有力保障。同时，也增强了企业对外界投资者和合作伙伴的透明度和公信力。