应付凭单部门主要负责以下工作：

处理凭单和账单

应付凭单部门的主要职责是处理企业的应付账款及凭单。包括接收、审核、分类、记录和跟踪各种凭单和账单，确保这些凭证的准确性和完整性。

与供应商管理相关的工作

1. 与供应商对账：应付凭单部门需与供应商进行定期的对账，确保双方的账务一致。

2. 付款安排：根据企业的资金状况，合理安排付款计划，确保及时支付供应商的货款。

内部控制和风险管理

应付凭单部门还要对企业的内部控制和风险管理负责。确保凭证的真实有效，防止虚假凭证和欺诈行为的发生。同时，密切关注供应链中的风险，确保企业供应链的稳定和安全。此外，还需要对企业的财务数据进行定期分析，为企业的决策提供依据。应付凭单部门还要进行财务预测，以应对可能出现的财务风险。

文档管理和归档工作

应付凭单部门还需对所有凭证进行归档管理，确保凭证的安全保管和方便查询。对于已经结算的凭单，要及时进行归档，以便日后审计或查询。同时，还需建立并维护相关的文档管理系统，提高文档管理的效率。在这个过程中也需要遵守相关法律法规，保证信息安全和数据隐私安全等。还需要保证整个部门的工作与企业的财务政策和法规保持一致。以确保企业运营的高效和合规性。此外还要积极与企业的其他部门保持沟通协作确保业务流程的顺畅运行等职责也是非常重要的工作内容之一。