主要区别有：

1、个体工商户适用《个体工商户条例》；个人独资企业适用《中华人民个人独资企业法》；

2、个体工商户不限制场所，可以流动摆摊；个人独资企业需要有固定的生产经营场所；

3、个人独资企业可以设立分支机构；个体工商户不可以设立分支机构；

4、个人独资企业可以变更投资人姓名；个体工商户只有在家庭经营的组成形式下才能变更经营者姓名，而且必须是家庭成员。