小规模企业在国家税务局代开增值税专用发票的，因为专用发票不免税，所以需要计提对应的税额，另外，企业增值税对应的附加税，也和增值税一起在代开的时候进行缴纳，其对应的会计分录为，

借：应收账款等，

贷：主营业务收入，

应交税费—应交增值税。

借：税金及附加，

贷：应交税费—应交城建税/教育费附加等。

缴纳税金的时候，

借：应交税费—应交增值税，

应交税费—应交城建税/教育费附加等。

贷：银行存款等。