借款从工资中扣除，可以直接在发工资的环节进行扣款，具体的账务处理如下：

发生借款时，

借：其他应收款—甲，

贷：银行存款或是库存现金，

进行工资计提时，

借：管理费用—工资，

贷：应付职工薪酬—工资，

进行工资发放时，

借：应付职工薪酬—工资，

贷：银行存款，

贷：其他应收款—甲，

贷：应交税费—应交个人所得税。