卖方代垫运费会计分录：

借：应收账款等，

贷：主营业务收入，

贷：应交税费-应交增值税-销项税额，

贷：银行存款、库存现金，

代垫运费是本该由购货方承担的运费，由于承运人不便到购货方收款，而由销售方代购货方垫付给承运部门，然后向购买方收回代垫款项。