公司组织全体旅游其中过路费属于企业的旅游这个事项的一部分，计入到管理费用—福利费科目进行核算，根据规定，福利费对应的进项税额不能抵扣，其分录为，

借：管理费用—福利费—通行费，

贷：应付职工薪酬—非货币性福利。

然后，

借：应付职工薪酬—非货币性福利，

贷：现金。