根据《国家税务总局关于印发〈个人所得税自行纳税申报办法(试行)〉的通知》（国税发〔2006〕162号）第十一条的规定，从两处或者两处以上取得工资、薪金所得的，选择并固定向其中一处单位所在地主管税务机关申报。

因此，你单位部分职工取得两处或者两处以上的工资、薪金所得，应当选择并固定向其中一处单位所在地主管税务机关申报。