单位购买材料需要支付的款项，是需要通过公司账户转账，这个是合法的。

单位购买材料的账务处理是，

借：原材料，

应交税费—应交增值税（进项税额），

贷：应付账款。

付款的时候账务处理是，

借：应付账款，

贷：银行存款。