企业支付佣金代扣代缴增值税抵扣的分录如下：

1、确认相关佣金费用时，账务处理如下：

借：销售费用—销售佣金，

贷：其他应付款。

2、支付佣金时，账务处理如下：

借：其他应付款—佣金，

贷：应交税费—代扣代缴增值税，

贷：应交税费—代扣代缴附加税，

贷：银行存款。

3、缴纳代扣税费时，账务处理如下：

借：应交税费—代扣代缴增值税，

借：应交税费—代扣代缴附加税，

贷：银行存款。