公司欠股东的款项，经过股东大会决定，可以将借款转为股东的资本，并在企业在工商局变更后，在税务局备案，并做如下会计分录，

借：其他应付款—XX股东，

贷：实收资本—XX股东。

需要说明的是，企业债权转股权，根据《财政部 国家税务总局关于企业重组业务企业所得税处理若干问题的通知》（财税〔2009〕59号）的规定，企业债务重组，相关交易应按以下规定处理：发生债权转股权的，应当分解为债务清偿和股权投资两项业务，确认有关债务清偿所得或损失。因此，企业以债权转股权应当按照上述文件规定进行企业所得税处理。如果是个人，也应该缴纳个人所得税。