以公司名义购买的商品房能抵扣增值税的，根据规定，2019年4月1日后，一般纳税人企业购入固定资产，既用于一般计税方法计税项目，又用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的，其进项税额准予从销项税额中全额抵扣。企业凭增值税专用发票，经认证后，均可以在认证当月一次性计入进项税额进行抵扣。