对方发票金额开多了进项税可以先全额勾选认证，等后期对方把多开的金额开具红字发票，然后申报的时候填附表二做进项税额转出处理；如果对方不把多开具的税额开具红字发票，那可以在勾选平台里面勾选的时候根据实际需要抵扣的税额填有效税额，多开具的税额不做进项税额抵扣。