收到差额征收的发票,应该按照发票上的金额和税额入账。企业接受应税服务时,按规定允许扣减销售额而减少的销项税额,借:应交税费--应交增值税(营改增抵减的销项税额)科目,按实际支付或应付的金额与上述增值税额的差额,借:主营业务成等科目,按实际支付或应付的金额,贷记“银行存款”、“应付账款”等科目。

对于期末一次性进行账务处理的企业,期末,按规定当期允许扣减销售额而减少的销项税额,借记"应交税费--应交增值税(营改增抵减的销项税额)"科目,贷记“主营业务成本”等科目。