独资企业纳税的方式主要包括以下几点：

纳税主体 ：独资企业不缴纳企业所得税，而是缴纳个人所得税。

税率

经营所得适用50%-35%的五级超额累进税率。

利息、股息、红利所得适用20%的比例税率。

征收方法

查账征收：适用于会计核算比较齐全的企业。

核定征收：适用于会计核算不齐全的企业，税务机关将核定应税所得率。

纳税申报

个人独资企业需要在月度或季度结束后十五日内向税务机关申报纳税。

在取得所得的次年三月三十一日前办理汇算清缴。

其他注意事项

纳税人身份确认，需注册登记并获得纳税人识别号。

纳税人应按规定缴纳增值税等其他税种。