苗木公司做账主要包括以下几个步骤：

收入核算

记录销售苗木的金额，包括苗木的售价和运输费用等。

成本核算

计算苗木的生产成本，包括种苗采购、种植、施肥、修剪、病虫害防治等费用。

区分消耗性生物资产和生产性生物资产的成本核算。

对于自行栽培的苗木，郁闭前发生的支出计入生产成本，郁闭后列入相关费用。

费用核算

记录公司的日常运营费用，如工资、水电费、办公费等。

绿化用苗木的支出可以计入管理费用中的绿化费。

税金计算

根据国家相关政策计算应缴纳的税费，如增值税、企业所得税等。

注意苗木种植可能享有免税政策，具体账务处理需根据相关法规执行。

确定利润

收入减去成本和费用，得出净利润。

编制报表

将上述核算结果整理成财务报表，如资产负债表、利润表等。

纳税申报

根据财务报表进行纳税申报。

在具体操作过程中，苗木公司需遵循会计准则和税法规定，确保账务真实、准确、完整。合理设置会计科目，定期进行财务分析，以便及时调整经营策略。