公司补税通常遵循以下步骤：

确定补税金额

核对纳税申报表和相关税务文件，计算出应补缴的税款金额。

填写补税申报表

根据税务机关要求填写补税申报表，包含纳税人信息、纳税期限、申报税种和金额等。

缴纳补税款项

将补缴的税款金额转入税务机关指定的账户，可通过银行转账、电子支付等方式。

提交补税申报表和付款证明

将填写完整的补税申报表和付款证明提交给税务机关。

备存相关材料

保存好补税申报表、付款证明和相关文件的副本，作为备案和纳税记录的证据。

获取完税证明

税务机关审核通过后，出具税收完税证明或收据。

后续跟进与记录

在公司内部记录补缴税款的情况，包括补缴日期、金额、税种等信息。

请注意，补税可能涉及滞纳金，具体金额和缴纳方式应遵循税务机关的规定。如果公司存在账目问题，应详细查阅税务稽查部门发出的正式文件，并遵循其指示进行补缴。