医院会计报税的基本流程如下：

账务处理

根据财务法则设立完善的账务制度。

由专门从业人员进行账务处理。

税务申报

登录电子税务局进行税务申报。

准备必要的财务报表，如资产负债表和损益表。

如有增值税，进行进项票认证。

进入开票系统进行发票管理。

税务缴纳

使用银联卡到税务部门进行税务申报。

在网上划账，对税费进行交纳。

申报成功确认

确认纳税申报成功，并可在系统中查询具体信息。

如有需要，可打印申报表和完税凭证。

请注意，医院可能享有某些免税政策，具体情况需要根据当地税务规定和医院资质进行确认。