房地产企业在缴纳税款时，主要涉及的税种包括土地增值税、营业税、印花税、企业所得税、房产税、城镇土地使用税等。以下是具体的缴税方法和规定：

土地增值税

计算依据：增值额。

税率：

增值额未超过扣除项目金额50%的部分，税率为30%。

增值额超过扣除项目金额50%但未超过100%的部分，税率为40%。

增值额超过扣除项目金额100%但未超过200%的部分，税率为50%。

增值额超过扣除项目金额200%的部分，税率为60%。

营业税

销售不动产：税率为5%。

转让土地使用权：税率为5%。

印花税

购房合同：按照成交价全额的0.05%缴纳。

企业所得税

出售房产收入：应缴纳企业所得税，即差额的25%。

房产税

自用、出租、出借商品房：自房屋使用或交付之次月起计征房产税。

自用房产税：年应纳房产税的税额 = 应税房产原值 × （1 - 10% - 30%） × 1.2%。

出租房产税：年应纳房产税的税额 = 房产租金收入 × 12%。

城镇土地使用税

自用、出租、出借商品房：自房屋使用或交付之次月起计征城镇土地使用税。

计算公式：年应纳税额 = ∑（各级土地面积 × 相应税额）。

增值税

一般纳税人：应预缴税款 = （全部价款和价外费用 - 不动产购置原价） ÷ （1 + 5%） × 5%。

小规模纳税人：应交增值税 = （全部价款和价外费用 - 不动产购置原价） ÷ （1 + 5%） × 5%。

其他注意事项

纳税人在项目全部竣工结算前转让房地产取得的收入，可以预征土地增值税，待项目全部竣工后办理清算。

房地产开发企业发生的期间费用、已销开发产品计税成本、营业税金及附加、土地增值税准予当期按规定扣除。

房地产开发企业按当年实际利润据实分季（或月）预缴企业所得税。

以上信息根据最新的税法规定和通知整理得出，具体税率和计算方法可能因地区和政策变动而有所不同。建议咨询当地税务机关或专业税务顾问获取最新信息