增值税普通发票上的运费处理方式如下：

原材料入账价值 ：原材料的成本包括买价、相关税费、运输费、包装费、挑选整理费等。

税费处理：

增值税普通发票上的税费应计入采购成本。

账务处理

借：原材料

贷：应付账款（或银行存款）

运费发票

运费可以开具增值税发票，但具体发票号码由发票机提供，请保留发票后面的小票。

运费抵扣

抵扣率：按照7%计算可以抵扣的进项税额。

计入成本：按照发票金额的93%计入运费的成本。

其他费用：

不包括装卸费、保险费等其他杂费。

请根据上述信息进行相应的会计处理。