总公司管理分公司通常采取以下几种方法：

1. 制定章程和制度：

制定分公司章程，规定总公司的控股比例和管理方式。

制定监察和激励制度，确保分公司的运营符合总公司的战略目标。

2. 财务内控：

财务委派制：财务人员由总公司委派，不受分公司经理管理，直接向总公司汇报。

收支两条线管理：设置收款和费用专户，确保资金的安全和合规使用。

完善的内部控制制度，包括三大本制度，确保财务业务的合法性和准确性。

定期审计：对分公司的财务状况进行定期审计，确保财务记录的准确性。

3. 人事管理：

总公司负责分公司的人事招聘、解聘等，确保人事管理的规范性和合法性。

4. 管理制度一致性：

确保分公司的管理制度与总公司保持一致，包括公司章程和规章制度。

5. 授权和责任：

明确分公司负责人和关键管理人员的职权范围和责任，防止权力滥用。

6. 业务监控和审查：

定期监控和审查分公司的业务活动，确保其符合法律和总公司的政策。

7. 授权控制：

总公司对分公司在一定授权范围内相对自主经营，超出授权范围的财务事项需报总公司批准。

8. 预算管理：

分公司实行预算制度，使资金“算了再用”，提高资金使用效率。

9. 会计核算和审计监督：

健全的会计核算和控制制度，以及专门的审计部门对分公司进行审计。

通过上述措施，总公司可以有效地管理和控制分公司，减少因管理不善导致的责任承担风险