对外承包工程公司出口货物退税的操作流程通常包括以下几个步骤：

出口货物报关

向海关申报出口货物，并提供必要的单证，如出口货物报关单（出口退税联）。

退税资格确认

确保企业具备出口退税资格，通常需要在国家税务局登记并获得认证。

提交退税申请

向主管出口退税的税务机关提交《出口货物退（免）税申请表》。

提供必要的支持文件，如购进货物的增值税专用发票、出口货物报关单（出口退税联）、对外承包工程合同等。

审核与放款

税务部门审核提交的退税申请及相关材料。

审核通过后，将退还相应税款至企业指定账户。

监督检查

海关、进出口管理部门和税务部门会对退税流程进行监督检查，确保合法性和准确性。

请注意，根据《国家税务总局关于生产企业开展对外承包工程业务出口货物退（免）税问题的批复》（国税函538号），对外承包工程业务出口生活物资实行免税办法，不退税。