项目经费的做账流程通常包括以下几个步骤：

编制预算：

项目负责人根据项目需求编制经费预算，并经批准后由财务部门审核。

经费申请：

项目负责人根据实际工作需要，向财务部门提出经费申请。

审批：

财务部门收到申请后，根据预算和实际情况进行审批。

资金划拨：

审批通过后，项目负责人将资金划拨至指定账户。

实施项目：

资金到账后，项目负责人按照项目进度和需求，将经费用于项目实施。

填写凭证：

具体到账时需填写相关凭证，如报销单、合同等。

财务审核：

财务部门审核无误后，进行资金支付。

项目验收和结算：

项目结束后，项目负责人需提交项目和财务报告，进行项目验收和经费结算。

会计分录：

根据项目收入和支出的具体情况，进行相应的会计分录处理。

税务处理：

横向科研经费凭税务票据入账，纵向科研经费拨款入账一般不再开具事业单位往来票据。

专款专用：

科研经费属于专项资金，需要设置专款支出账户，进行明细核算。

入账手续：

项目负责人到财务部门领取特种转账凭证，办理入账手续。

发票管理：

需要开具增值税发票的，到财务部开具，并在财务系统中进行到款查询和打印到款凭证。

费用报销：

项目过程中发生的费用，如材料费、测试化验加工费等，需要提供相应的发票和合同，并进行报销。

前期费用：

工程项目立项前期费用通过设立专项成本科目进行账务处理。

在建工程：

在项目建设期间发生的费用，如日常修理费、更新改造支出等，应记入“在建工程”科目。

整个流程需要严格按照国家财务规定和单位财务制度执行。