差额纳税的计算方法如下：

计算销售额

销售额 = 含税销售额 - 销售额折扣 - 销售不含税额。

计算进项税额

进项税额 = 购进含税额 × 税率。

计算应纳税额

应纳税额 = 销售额 - 进项税额。

对于一般纳税人和小规模纳税人，计算公式稍有不同：

一般纳税人：

计税销售额 = （取得的全部含税价款和价外费用 - 支付给其他单位或个人的含税价款） / （1 + 对应征税应税服务适用的增值税税率或征收率）。

小规模纳税人：

计税销售额 = （取得的全部含税价款和价外费用 - 支付给其他单位或个人的含税价款） / （1 + 征收率）。

请注意，差额纳税的纳税人只能抵扣进项税，而不能享受抵扣其他税费的权利