对于已认证但未抵扣的进项发票，您可以按照以下步骤处理：

确认原因

客观原因：如自然灾害、办税人员伤亡、突发疾病或擅自离职等，可以向税务局提供书面情况说明，并申请补申报。

主观原因：如忘记或申报漏了等，通常情况下，已认证的发票不能补申报。

补申报

如果是客观原因，您可以向主管税务机关提交书面申请，并提供相应的证明材料，请求继续申报抵扣进项税额。

如果是主观原因，通常无法补申报，但您可以考虑其他补救措施，如进项税转出。

进项税转出

如果不打算抵扣已认证的进项税，可以将其转出，计入相关成本或费用。

会计分录示例：

```

借：库存商品（在建工程、原材料、销售费用等）

贷：应交税费——应交增值税（进项税转出）

```

申报期限

注意从进项发票开具之日起360天内必须抵扣，通常每月15日以前需进行纳税申报。

发票认证与申报

确保发票真实有效，并在规定的申报期内通过电子税务局或税务局柜台进行申报。

滞纳金问题

如果逾期提交申报表，可能需要缴纳滞纳金。

请根据具体情况采取相应措施，并咨询税务专管员以获得具体指导。