会计代理费通常计入 管理费用科目。管理费用是指企业行政管理部门为组织和管理生产经营活动而发生的各项费用，包括企业在委托代理业务中支付给代理人的合理费用。

具体会计分录如下：

1. 发生代理费时：

借：管理费用——代理费

贷：银行存款/库存现金

2. 支付代理费时：

借：应付账款——公司名称

贷：银行存款

3. 期末结转利润时：

借：本年利润

贷：管理费用——代理费

建议在实际操作中，根据企业的具体情况和合同条款，确保准确无误地计入相关科目，并在财务报表中予以恰当披露。