农户开具发票的流程通常包括以下几个步骤：

自产证明

农户需要先获得村级的自产证明，证明所销售的农产品是自产的。

然后到镇政府再次确认农产品的自产性质。

税务登记

农户应确保已经在税务机关进行了税务登记，并且了解自己的纳税人身份（一般纳税人或小规模纳税人）。

选择发票类型

如果农户是自产自销农产品，可以选择开具免税发票。

如果农户销售非自产农产品，则需要开具增值税专用发票，税率为11%。

开具发票

使用农产品销售统一发票或增值税普通发票，如果是注册为一般纳税人，也可以开具增值税专用发票。

在开票软件中填写销售方信息（农户信息），商品名称及税收编码，并确保选择免税商品。

填写完毕后，农户可以在开票软件中开具发票，并可以选择将发票发送到指定邮箱或手机号，或通过电子方式领取和分享。

提交发票

开具发票后，农户需要将免税发票交给收购单位，作为收款依据。

保存发票

收购单位也需要妥善保管发票，作为后续税务申报和核算的依据。

请根据最新的税法规定和税务机关的指导进行操作，因为税法和相关流程可能会有更新。如果有任何疑问，建议咨询当地税务机关或专业税务顾问