商业折扣在开票和作账时的处理方式如下：

商业折扣的开票方式：

在同一张发票上注明

如果销售额和折扣额在同一张发票上分别注明，可以按折扣后的销售额征收增值税。

例如，商品原价1000元，商业折扣10%，折扣额100元，若在发票上分别注明销售额900元与折扣额100元，则按900元计算增值税。

折扣额另开发票

如果折扣额另开发票，不论财务上如何处理，均不得从销售额中减除折扣额。

商业折扣的账务处理：

销售方

按折扣后的金额确认主营业务收入，并据此计算销项税额。

例如，销售商品原价1000元，商业折扣10%，则销售方按900元确认收入，并计算销项税。

购买方

按折扣后的金额确认采购成本，并据此计算进项税额。

例如，购买商品折扣后价格为900元，则购买方按900元确认成本，并计算进项税。

开具折扣发票的步骤：

1. 登录电子税务局，选择“发票业务”→“蓝字发票开具”→“立即开票”。