资产转让收入确认收入的方法通常遵循以下步骤和原则：

收入确认时点

转让协议生效且完成股权变更手续时，确认收入的实现。

收入计算

转让收入减去财产原值和合理的费用后的余额为应纳税所得额。

对于股权转让，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中可能分配给该股东的金额。

相关凭证和资料

股权转让合同、财务凭证、资产评估报告、被投资公司的财务报表、投资款付款证明等。

若涉及直系亲属间转让，需提供直系亲属关系证明。

税收处理

转让收入应一次性计入确认收入的年度计算缴纳企业所得税。

股权转让收入应按照公平交易原则确定。

特殊情况下的收入核定

如果纳税人未提供完整、准确的财产原值凭证，主管税务机关可以采取净资产核定法、类比法或其他合理方法核定股权转让收入。

非货币性资产投资

以非货币性资产对外投资时，应于投资协议生效并办理股权登记手续时，确认非货币性资产转让收入的实现。

以上步骤和原则为一般性的指导，具体操作可能因地区、行业和具体情况而异。建议在实施资产转让前咨询当地税务机关或专业税务顾问，以确保符合当地税法规定