公司发票冲抵成本的操作步骤如下：

确定发票类型

确定要冲抵的发票类型，如增值税专用发票、普通发票等。

核对金额

将要冲抵的发票与被冲抵的发票的金额进行核对，确保无误。

填写冲抵联

将要冲抵的发票填写在冲抵联上，注明被冲抵的发票信息，如发票号码、金额等。

提交审核

将冲抵联与被冲抵的发票一起交给开票方或税务机关进行审核。

冲抵操作

审核通过后，将冲抵联粘贴在原发票背面，并在发票上注明冲抵日期和冲抵金额。

合法使用

冲抵后的发票可以作为合法凭证使用。

请注意，发票冲抵必须在有效期内进行，且冲抵金额不得超过原发票金额。冲抵过程中要确保发票信息准确无误，避免造成不必要的麻烦。