金蝶专业版进行初始化的步骤如下：

1. 打开金蝶KIS专业版软件。

2. 在软件主界面选择“初始化”菜单。

3. 在“初始化”菜单下，选择“账套管理”进行操作。

4. 在“账套管理”界面，可以进行账套的新建、备份、恢复等操作。

5. 如果需要导入初始数据，可以选择“初始数据导入”功能，并选择相应的数据文件进行导入。

请根据实际需要选择相应的初始化选项进行操作