出纳短款查找原因的方法主要包括：

除2法

适用于收支搞反的情况，例如支出记为收入，导致账面上短款。

计算方法：将短款金额除以2，得出的商数即为账中记错方向的数字。

除9法

适用于数字颠倒或错位的情况。

计算方法：将短款金额除以9，得出的商数即为账中记错数字。

核对账目

仔细检查账单，确认是否记账、结账有误。

审查收款付款记录，核对是否少收或多付。

回忆业务

出纳员应回忆当天的现金收付业务，注意金额、票面面额及特征。

查找线索

检查是否有单据遗漏或未记录，是否有人借款或条据存放他处。

挂账处理

如果经过核对仍无法找到原因，可暂时挂账处理。

责任追究

根据原因追究责任，若是个人失误需自行承担损失，若是管理不善则由负责人承担。

会计鉴定