运费在会计科目中的处理取决于运费支付的具体情况：

1. 当运费是在销售商品时支付的，通常会计入“销售费用”科目。

2. 如果运费是在购买商品或原材料时支付的，则应计入“运输成本”或“采购成本”科目。

3. 对于与生产相关的运费支出，可能会计入“制造费用”科目。

4. 作为企业的固定成本，运费有时也可以计入“管理费用”科目。

5. 在某些情况下，运费可能作为应付账款处理，记在“应付账款”科目下。

具体的会计分录示例如下：

销售商品支付运费的会计分录：

应交税费——应交增值税（进项税额）

贷：银行存款

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购进货物支付运费的会计分录：

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借：库存商品/原材料

应交税费——应交增值税（进项税额）

贷：银行存款