企业在搬迁过程中通常需要缴纳的税种主要包括：

企业所得税

企业取得的搬迁补偿款，在扣除搬迁费用支出、资产处置支出以及可能发生的固定资产重置或改良支出、技术改造支出和职工安置支出后的余额，应计入企业应纳税所得额计算纳税。

如果企业在搬迁过程中购置或改良固定资产，相关支出可以从搬迁补偿收入中扣减，改良后的固定资产折旧也可以税前扣除。

搬迁补偿收入在一定条件下（如政策性搬迁）可以不计入当期应纳税所得额，而是在搬迁完成的年度进行汇总清算。

土地增值税

通常情况下，因国家建设需要依法征用或收回的房地产免征土地增值税。

政策性搬迁中，如果涉及土地使用权转让，可能也需要缴纳土地增值税，但具体情况需要根据当地税务机关的规定和审批。

营业税及增值税

政府收回土地使用权通常免征增值税。

企业取得的拆迁补偿费，如果涉及土地使用权转让，可能需要缴纳增值税。

印花税

在企业取得搬迁补偿款的过程中，涉及的相关合同和财务账簿可能需要缴纳印花税。