当单位的发票丢失时，可以按照以下步骤补办：

复印存根联并盖章

将存根联复印，并在复印件上盖章。

交给客户入账

将复印的存根联交给客户，以便他们进行入账处理。

设置发票登记本

财务人员应设置发票登记本，记录购入发票的数量、号码，以及开出的发票号码、日期、客户、金额和领取人信息。

客户回签

请求客户在存根联的复印件上签字确认。

报告税务机关

向开具发票的单位和当地税务机关报告发票丢失的情况。

登报声明作废

在当地报纸上刊登声明，宣布丢失的发票作废。

重新开具发票

根据税务机关的指示，重新开具发票或获得相应的证明文件。

保存记录

保存所有相关的记录和文件，包括存根联的复印件、客户回签、税务机关的证明文件等，以备未来查验。