当货款已付但尚未收到发票时，会计入账处理通常有以下几种方法：

暂估入账

付款时：借：预付账款/应付账款

贷：银行存款

收到货物时：借：库存商品/原材料

贷：应付账款——暂估

收到发票时：借：库存商品/原材料（红字）

贷：应付账款——暂估（红字）

根据发票入账：借：库存商品/原材料

贷：应交税费——应交增值税（进项税额）

贷：预付账款/应付账款

预收账款处理

收到货款未开票时：借：银行存款

贷：预收账款

使用其他合法凭证

如果无法获得正规发票，可以尝试使用合同、付款凭证、银行转账记录、收据等作为补充凭证。

财务调整

如果无法提供任何凭证证明交易的发生，可以在财务报表中进行相应的调整，例如将这部分收入或支出列为“其他收入”或“其他费用”。

自制发票

如果公司确实发生了交易但无法获得正规发票，可以考虑自制发票，并确保其合法性和合规性。

分割单税前扣除

根据企业所得税法，企业可以使用分割单作为税前扣除凭证之一。

请注意，无论采取哪种方式入账，都应确保透明度和合规性，并符合当地税务机关的规定和要求。在实际操作中，建议咨询专业的会计师或税务顾问，以确保会计处理的正确性和合法性