公司开具发票后，按照以下步骤进行缴税：

确认收入与税额

开具发票以确认收入金额及应纳增值税税额。

计算所得税额

基于每一纳税年度的收入总额，减去不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，计算出应缴纳的所得税额。

缴纳企业所得税

根据计算出的利润数额，按照规定的税率缴纳企业所得税。

记录和核算税费

通过设置“应交税费”会计科目详细记录各种税费的缴纳情况，并进行分类核算。

纳税申报

根据税法规定，选择合适的纳税方式（如查账征收或核定征收），并在税务局规定的期限内提交纳税申报表。

缴纳税款

可以通过网上申报、银行转账或到税务局窗口缴纳税款。