财付通作为第三方支付平台，当公司通过财付通收到款项时，会计记账可以按照以下步骤进行：

设置账户

在会计账目中设置一个“其他货币资金”账户，专门用于记录财付通账户中的资金变动。

收款记账

当公司账户收到财付通转入的款项时，会计分录为：

```

借：银行存款/其他货币资金—财付通

贷：应收账款/预收账款等

```

如果款项是作为销售收入，则进一步分录为：

```

借：银行存款/其他货币资金—财付通

贷：主营业务收入

贷：应交税费-应交增值税-销项税

```

款项划出记账

当款项从财付通划出时，如果是代他人收款，会计分录为：

```

借：其他应付款—某单位

贷：银行存款/其他货币资金—财付通

```

如果款项是公司的支出，则根据实际情况进行记账，例如支付给供应商：

```

借：应付账款/其他应付款—某单位

贷：银行存款/其他货币资金—财付通

```

手续费处理

如果财付通转入的款项中包含了手续费，则需先处理手续费部分：

```

借：银行存款/其他货币资金—财付通

财务费用—手续费

贷：主营业务收入

```

收到发票后，如果涉及费用，则进行如下记账：

```

借：财务费用

贷：预付账款—财付通

```

请根据实际业务性质和会计政策进行准确记账。