防洪费应计入管理费用科目，具体为管理费用——小税种。这是根据企业会计制度的规定，企业交纳的防洪费用应当记入当期管理费用中。

会计分录如下：

计提防洪费时：

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借：管理费用——小税种

贷：其他应付款——防洪费（或应交税费科目）

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缴纳防洪费时：

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借：其他应付款——防洪费（或应交税费科目）

贷：银行存款

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