运输款的会计处理取决于支付运输款的具体情况：

1. 如果支付的是购进货物的运输费，则应计入货物成本中，例如原材料或库存商品的成本。

2. 如果支付的是销售货物的运输费，则应计入销售费用中。

3. 如果支付的是与物流运输服务相关的费用，且服务提供商是外部单位，则可能计入物流费用或运输成本科目。

4. 对于运输公司而言，收到的运费应计入主营业务收入。

具体的会计分录示例如下：

购进货物时支付运输费：

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借：原材料/库存商品

贷：银行存款

```

销售货物时支付运输费：

```

借：销售费用

贷：银行存款

```

运输公司收到运费：

```

借：银行存款/应收账款

贷：主营业务收入

应交税费——应交增值税（销项税额）

```

请根据您的具体情况选择合适的会计科目进行核算