申请百万面额发票的步骤通常包括：

准备申请资料

税务行政许可申请表

增值税专用发票最高开票限额申请单

经办人身份证件

代理委托书（如有代理人）

代理人身份证件（如有代理人）

提交申请

将准备好的资料提交至当地税务机关。

实地核查

税务机关根据申请额度进行实地核查。

批准使用最高开票限额为一百万元的，由地市级税务机关派人实地核查。

审批流程

实地核查通过后，资料上报至上级税务机关进行审核。

系统操作

在开票系统中填写开票申请，包括购买方名称、供应方名称、开票金额等信息。

发票开具

系统审核通过后，进行发票打印、签字、登记等操作。